Materialien zum Thema Protein Modellierung


Diese Seiten stellen begleitende Unterlagen zum Thema Protein Modelling zur Verfügung, mit deren Hilfe das Ausprobieren der vorgestellten Konzepte und Methoden leichtert werden soll.

Datenbanken
Sequenzdatenbanken und Retrievalsysteme
MultifunktionsServer und Sequenzanalyse
Fachliteratur und Information
Liste Datenbanken mit Moleküldaten und 3D-Informationen

Alignment
Paarweises Alignment - BLAST, FASTA, Smith-Waterman (auch Suche in Datenbanken)
multiples Alignment - Tips
Sequenzen an Sekundärstrukturen
Sequenzen an 3D-Strukturen

Sekundärstruktur-Vorhersage
Server - XSSP-Datenbanken am EMBL

Fold Recognition - Threading - Inverse Folding
Allgemeines
Software Folding, Threading, Template Identification
Analyse einer Faltung
Protein-Protein Wechselwirkungen

Rund um 3D-Strukturen
Homologie-Modellierung - Proteindatenbanken, Software zur Modellierung, Validierung und Analyse, Oberflächen, Elektrostatik, Artikel
RNA und DNA
Domänen und Patterns/Sites in Proteinsequenzen, Überlagerung von Proteinen anhand von Domänen
Membranen
Visualisierung von Proteinstrukturen und Eigenschaften, Builder-Software (auch für kleine Moleküle)
Funktion und Interaktion von Proteinstrukturen

Ligands - Small Molecules
Docking Software, Scoring, Ligand and Interaction Databases, Data Analysis
WirkstoffdesignWebsites, Artikel, Dokumentationen
Freie Energien von Mutationen, Protein-Protein- und Protein-Ligand-Interaktionen

Sonstiges
Listen mit Web-Recourcen - Chemie - CompChem - Biologie - Software - Distributed Computing - MS Office
Lehrmaterial, Workshops, Kurse und Vorlesungen


Updated Feb 06, 2012 by Harald Lanig